Отдел планирования и организации налогового контроля.
Отдел специальных проверок.
Отдел проверок качества налогового контроля.
Отдел контроля за проведением наличных расчетов.
Отдел проверок крупных предприятий.
Отдел организации проверок финансовых учреждений.
Отдел сопровождения особо важных проверок.
Отдел информационного обеспечения и аналитической работы.
Отдел контроля за операциями в сфере ВЭД.